胆管结石没有绝对“最好”的治疗方法，治疗方案需根据结石的位置、大小、数量以及是否引起梗阻、感染等并发症综合决定，目前以内镜逆行胰胆管造影取石和腹腔镜胆总管探查术为主要手段。胆管结石的治疗方法主要有内镜治疗、腹腔镜手术、开腹手术、药物治疗和体外碎石等。
内镜逆行胰胆管造影是目前治疗胆总管结石的首选微创方法，尤其适用于单纯胆总管结石或胆囊切除术后残留的胆管结石。医生通过口腔将十二指肠镜送达十二指肠乳头，使用专用器械将结石取出或碎石后排出。这种方法创伤小、恢复快，但若结石巨大或位置特殊，可能需要分次进行或联合其他治疗。
腹腔镜胆总管探查术适用于胆囊结石合并胆总管结石的患者，可在切除胆囊的同时探查并取出胆管内的结石。这种方法能一次性解决胆囊和胆管两个部位的问题，避免了二次手术。术后患者疼痛轻、住院时间短，但对医生技术要求较高，且不适合有严重腹腔粘连或心肺功能差的患者。
开腹胆总管切开取石术是传统的手术方式，适用于内镜或腹腔镜治疗失败、结石巨大或伴有胆管狭窄、畸形等复杂情况的患者。虽然创伤较大、恢复较慢，但能充分暴露手术视野，处理各种复杂病变，是其他微创方法无效时的可靠保障。
药物治疗主要适用于直径较小、未造成完全梗阻的胆固醇性结石。常用药物包括熊去氧胆酸胶囊、鹅去氧胆酸胶囊等，通过改变胆汁成分促使结石溶解。但药物治疗周期长，通常需要半年以上，且对钙盐含量高的结石效果不佳，停药后复发率较高，一般作为辅助治疗或无法耐受手术者的选择。
体外冲击波碎石适用于部分胆管结石，通过体外产生的冲击波将结石击碎，使其随胆汁排出。这种方法无需开刀，但适用范围较窄，对结石的硬度、位置有严格要求，且可能损伤周围组织，引起胆管炎或胰腺炎，目前已较少单独使用，多作为内镜或手术前的辅助手段。
胆管结石患者日常应注意低脂饮食，避免暴饮暴食，适量饮水促进胆汁排泄。若出现右上腹疼痛、发热、黄疸等症状，提示可能发生急性胆管炎，需立即就医。术后患者应遵医嘱定期复查，避免结石复发。所有治疗方案的选择都应在专业医生评估后进行，不可自行用药或尝试偏方。
