男性支原体感染主要通过一般治疗、物理治疗、大环内酯类、四环素类、喹诺酮类等方式治疗，常用药物有阿奇霉素片、多西环素片、左氧氟沙星片等。
一般治疗是支原体感染的基础措施，适用于所有男性患者。患病期间应保证充足休息，避免劳累，多饮水以增加尿量，帮助冲刷尿道。饮食上选择清淡易消化的食物，不吃辛辣刺激性食物，戒烟戒酒。治疗期间禁止性生活，避免交叉感染，同时注意个人卫生，勤换内裤并单独清洗，保持会阴部清洁干燥。若性伴侣也有感染症状，建议双方同治，否则容易反复感染。
物理治疗可作为支原体感染的辅助手段，包括局部热敷、微波治疗等。这些方法能促进盆腔及会阴部的血液循环，减轻炎症水肿，缓解坠胀、疼痛等不适感，尤其适用于合并慢性前列腺炎的患者。物理治疗需在医生评估后进行，操作时应控制温度和时间，避免烫伤局部皮肤。物理治疗不能替代抗感染治疗，需与药物联合使用才能取得较好效果。
阿奇霉素片是大环内酯类抗生素的代表药物，对支原体具有较好的抗菌活性，常用于治疗由敏感支原体引起的尿道炎、前列腺炎等泌尿生殖系统感染。该药物通过抑制支原体蛋白质合成而发挥抑菌作用，临床使用较为广泛。阿奇霉素片属于处方药，患者必须遵医嘱服用，不可自行更改剂量或延长疗程，以免诱导耐药或出现胃肠不适等不良反应。
多西环素片属于四环素类抗生素，也是治疗支原体感染的常用选择之一，对解脲支原体和人型支原体均有较好的抑制作用。其作用机制为干扰支原体蛋白质合成，从而抑制其生长繁殖。多西环素片应在医生指导下使用，用药期间可能出现恶心、呕吐、光敏反应等不适，服药后不宜长时间日晒。对于妊娠期或哺乳期男性患者的伴侣，应提前告知医生相关情况。
左氧氟沙星片是喹诺酮类抗生素，对支原体感染引起的尿道炎、附睾炎等具有一定的治疗效果，尤其适用于对上述两类药物耐药或过敏的病例。该药通过抑制细菌DNA旋转酶而发挥杀菌作用，临床应用需注意其可能引起头晕、失眠、光敏性皮炎等副作用。左氧氟沙星片同样是处方药，患者须在医生全面评估后使用，治疗期间不宜驾驶或从事精细操作。
男性支原体感染患者治疗期间应保证规律作息，避免熬夜，适当进行散步、打太极拳等有氧运动以增强体质，但避免剧烈运动刺激会阴部。饮食上可增加鸡蛋、牛奶、瘦肉、新鲜蔬菜水果等富含优质蛋白和维生素的食物，帮助提高免疫力。同时注意多饮水、勤排尿，避免久坐和憋尿，穿透气棉质内裤，保持局部干燥。治疗过程中应严格遵医嘱完成整个疗程，即使症状缓解也不能自行停药，避免支原体耐药和复发。治愈前禁止无保护性行为，性伴侣如有感染需同步接受规范治疗，以免交叉感染。
