众所周知，生殖器疱疹的感染性非常强。有关资料显示，与患有生殖器疱疹的病人经过一次性接触，大约就会有80%的人被感染上生殖器疱疹。正因为如此，一些人认为既然生殖器疱疹是感染单纯疱疹病毒后引起的，那么在不洁性生活后，服用抗菌药或定期服用抗菌药就可以预防生殖器疱疹，甚至是其他性传播疾病，甚至有些资料也认为，这种预防性用药有一定的预防性传播疾病的效果。
但这种预防性用药行为却是有害的，医药领域的绝大多数专家也是不赞同这种做法的。首先像生殖器疱疹、尖锐湿疣这类的性传播疾病，都是由病毒引起的，抗菌药针对的是细菌，而对病毒是完全没有效果的，这无疑是助长了滥用抗菌药的行为。另外，即便是细菌引起的性传播疾病，也不可能保证服用的抗菌药正好就是针对致病菌的，还没有一种抗菌药是针对任何性病都有效果的。再有，以预防为目的应用抗菌药的行为，无论从用药疗程、用药剂量、药品的选择上都没有得到严格的论证，这是不科学的用药行为。
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