慢性细菌性前列腺炎的诊断仍然是要依靠详细的病史资料、全面的体格检查(包括直肠指检)以及尿液和前列腺液的常规检查。
但由于慢性细菌性前列腺炎的症状变异较大，临床表现常与慢性非细菌性前列腺炎类似，所以不能单独依靠临床表现，而是要结合体格检查、特别是实验室检查的结果进行诊断。
其特征是前列腺液细菌培养有致病菌存在，致病菌与引起感染复发的细菌相同。另外，慢性细菌性前列腺炎常有反复的尿路感染发作和前列腺按摩液中持续有致病菌存在。
1)直肠指诊：前列腺饱满增大、质软、轻度压痛病程长，前列腺可缩小、变硬、有小硬结。
2)前列腺液检查：白细胞大于10个/HP，卵磷脂小体减少。可诊断为前列腺炎。
3)分段尿及前列腺液培养检查：检查前充分饮水，取初尿10ml(VB1)，再排尿200ml取中段尿10ml(VB2).再做前列腺按摩，收集前列腺液(EPS)，完毕后排尿10ml(VB3)，均送细菌培养及菌落计数。
菌落计数VB3>VB110倍可诊断为细菌性前列腺炎若VB1及VB2细菌培养阴性，VB3和前列腺液细菌培养阳性，即可诊断为细菌性前列腺炎
4)B超显示前列腺组织结构界限不清、混乱，可提示前列腺炎。
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