间质性膀胱炎是一种慢性非细菌性膀胱炎。2003年国际尿控学会将间质性膀胱炎定义为是一种与膀胱充盈相关的耻骨上疼痛，伴随昼夜排尿次数的增加，但无泌尿系感染等其他疾病。
间质性膀胱炎，从其被发现到目前为止，已经有100多年了，但遗憾的是，医学界仍未发现其准确的病因。目前存在以下几种假说，这些假说在某种程度上不止适用于间质性膀胱炎，同样适用于其他膀胱炎。
(1)尿路感染。尿路感染是指尿路内有大量的细菌繁殖，而引起尿路的炎症反应。尿路感染包括尿道炎、膀胱炎、前列腺炎和肾盂肾炎等疾病。
(2)肥大细胞激活。间质性膀胱炎的肥大细胞位于膀胱粘膜下层和逼尿肌中，激活后会引起血管扩张、充血、炎细胞渗出、趋化。
(3)黏膜上皮通透性增加。正常膀胱黏膜表面存在一层连续的保护层包括氨基葡聚糖、离子泵、不对称的单位膜及高度的蛋白聚糖等成分，可以防止尿液中细菌的黏附及毒性成分对肌层的破坏。
间质性膀胱炎患者膀胱黏膜上皮葡聚糖层明显减少，导致黏膜通透性增加，化学物质渗透至粘膜下层，导致接触性损伤和炎症，刺激疼痛神经，导致疼痛症状。
(4)免疫学因素。临床上常常发现间质性膀胱炎与某种或多种免疫性疾病并存，因此其发病可能与免疫有关。
(5)尿液毒性成分。尿液中一些小分子阳离子或难以培养的致病菌，损伤尿路上皮和平滑肌细胞。
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