再生障碍性贫血主要有三大症状，即贫血、出血和感染。这是由于发生再生障碍性贫血时，患者体内的红细胞减少所引起的。绝大多数的再障患者发病缓慢，病程也较长，临床上称之为慢性再障，而人们一般所说的再障即指慢性再障而言。
再生障碍性贫血的主要症状如下：
慢性再生障碍性贫血
慢性再障患者几乎都是由贫血开始发病的。患者虽然血小板减少，但出血的症状很轻，一般表现为皮肤出血点或轻微的齿龈出血，比如刷牙时齿龈出血，女性患者可能有月经过多的表现；虽然慢性再障患者的白细胞减少，但有严重感染者甚少，且感染者大多为感冒。
慢性再障患者的病程长，经过治疗后大约有1/3患者可治愈，1/3进步，1/3迁延不愈。只有极少数的慢性再障患者可能变成急性，死于出血或感染。
急性再生障碍性贫血
急性再障发病急骤，除贫血外常有出血或发热感染。急性再障患者的出血现象十分严重，不仅表现在皮肤、黏膜（如齿龈、口腔、鼻黏膜等）出血还常有多处内脏出血，包括消化道（便血）、泌尿道（血尿）、子宫出血以及脑出血，且出血量较多；
而急性再障患者发热及感染严重时，体温常超过39℃，最常见的感染是呼吸道如肺炎和口腔黏膜感染，也有皮肤化脓，蜂窝织炎和败血症等。严重的感染常会加重出血现象，而出血又容易继发感染，同时出血和感染都可以加重贫血，导致病情地迅速恶化。
急性再障的预后凶险，死亡率高达65%~75%，大多数患者于半年内死亡，半数于3个月内死亡，只有少数患者经治疗可以转为慢性型再障。
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