外用治疗也是灰指甲常用的治疗方法，根据药剂不同，主要有浸泡、局部涂药和封包削治疗方法。在使用外用治疗前，灰指甲患者需先用小利刀刮除松脆病甲，或挫薄增厚的病甲。
封包法
治疗甲癣的最好方法是药物封包法，选用10%水杨酸软膏、复方苯甲酸软膏或20%~40%尿素乳膏涂在病甲上（周围皮肤用胶布保护好），病甲用塑料薄膜和纱布包3层1~2日更换1次，连续1~2周。
此时，如甲板软化，可以0.02%高锰酸钾溶液浸泡，并用刀片剥削使病甲剥离；如甲板可被移动，将甲板从甲床上提起，然后在远端甲皱处将其异常部分的甲割去。再涂复方苯甲酸软膏或2%碘伏，直到新的甲板长出。
外涂法
外涂法的常用药物有巴特芬（环吡酮C），8%溶液，2.5克／瓶；达克宁（硝酸咪康唑），2%散剂，20克／瓶，乳膏15克／支；阿莫罗芬（罗每乐，高德美），5%甲涂抹剂，2.5~5毫升／瓶。每周1~2次。指甲真菌病疗程6个月。
浸泡法
较为适用的方法是浸泡法。先用10%醋酸溶液浸泡病足30分钟，将增厚的病甲削薄，甲板外周先涂凡士林保护甲沟，然后用30%冰醋酸溶液，或将3%、5%的乳酸碘酊涂在病甲上，每日1次，连续3~6个月。
采取手足局部整体浸泡的方法进行治疗（一般需浸泡整个甲板），目的是使药物强力渗透至甲板深部及皮肤角质层，彻底杀灭寄生在甲板角质内，以及周围皮肤角质层内所有的真菌，使灰指（趾）甲得到整体治疗而根治，杜绝复发的产生。患有灰指甲的患者在用药15~25日可在指根部长出新甲，持续用药待新甲全部长出，病甲全部剪掉，病患消除得到根治，治疗过程中不会产生任何不良反应。
注：药物剂量需咨询药师或医师。
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