药物是治疗甲亢的一种常用方法，可以避免手术治疗带来的较大风险，但用药不当同样会给患者带来一些副作用，应用时需特别注意以下几点。
1、服药期间如用药不当可出现皮疹、发烧、关节痛、恶呕、腹泻、瘙痒等副反应，如果症状比较轻，可以服用一些西药，如果症状严重一定要去医院就诊，在医生的指导下用药。
2、精神紧张的甲亢患者可适服镇静剂，如安定、利眠宁。轻症者若入睡时脉搏低于80次/分钟，可以不服药物。
3、妊娠期治疗甲亢的药物，目前一般选用丙基硫氧嘧啶（PTR）、他巴唑，如药物剂量恰当，对母体、胎儿不致有害。一般每日100毫克以下最安全。
4、抗甲状腺药物可自由进行胎儿体内，药剂宜小，若剂量过大，早孕期可引起流产，并影响胎儿甲状腺及脑与骨的发育。
妊娠期甲亢患者忌用放射性同位素诊断、治疗，以防对胎儿的影响。
当出现原有症状加重，并有躁动不安、嗜睡、昏边、高热（39度以上）、心率每分钟140次以上时，应立即住院治疗，切不可耽误时间。
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