系统性红斑狼疮是一种常见的自身免疫性疾病，可累及关节、皮肤等多个组织，其临床表现很容易与其他疾病混淆，如类风湿性关节炎、药物性狼疮、多发性肌炎等等，因此诊断时须加以鉴别。
1、类风湿性关节炎
类风湿性关节炎以关节和关节周围组织非化脓性炎症为主，关节病变呈持续性，程度较重，晨僵时间长，畸形多见，全身损害少见，X线显示侵蚀性关节炎，血清中可查到自身抗体。而系统性红斑狼疮有典型皮疹，关节病变为非侵蚀性，多有肾脏病变，抗Sm抗体、抗dsDNA抗体阳性。
2、药物性狼疮
药物性狼疮常有服药史，主要表现为发热、管型尿、显微血尿和氮血症少见，DNA抗体多阴性，病情较轻，与系统性红斑狼疮最大的区别在于药物性狼疮常于停药后消失，再次用药很快再发病。
3、多发性肌炎
多发性肌炎可表现为关节痛或多关节炎，肌肉酸痛无力，以上眼睑暗紫色涨红为特征，而系统性红斑狼疮虽然也有皮肤及肌肉病变，但肌无力、肌肉疼痛症状较轻、肌酶谱多正常、肌电图无特异性改变。
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