所有药物都有毒副作用，抗癫痫药物也不例外，特别是足剂量的长期用药，使抗癫痫药物更容易发生副作用。目前临床上常用的抗癫痫药物都是经过长期大量反复的临床实验，有效率为70%～80%，被证明其确实是疗效好，毒副作用相对较小的药物。
许多家长错误地认为抗癫痫药物长期服用会影响孩子的生长发育，损害身体健康，实际上抗癫痫药物的毒副作用与其抗癫痫作用相比要小得多，而且仅有少数或极少数患者才会出现这些毒副作用，而决大多数患者服药后都是安全的。在这些极少出现的毒副作用中，多数情况下都是损害是可逆的。例如大部分抗癫痫药物都可能造成肝功能损害，肝功能检查会发现转氨酶异常，联合应用保肝药物后可好转，在治疗疗程结束后一般都能自行恢复。
患者和家属应积极配合医生治疗，定期复查血常规、肝功能等检查醒目，及早发现药物毒副作用，积极处理，一般不会造成严重后果。对过量用药造成药物毒副作用者应适量减药；个别特异性体质对某些药物过敏者，可及时更换成其他同类抗癫痫药。
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