患有癫痫的女性妊娠的胎儿畸形率较正常人高，导致这一不良结果多与服用抗癫痫药物有关。
在传统的抗癫痫药物中，苯妥因钠的致畸率高达11%，而且表现是多种多样的，如内眦赘皮、斜视、双眼距过宽、耳异常、大嘴及突唇、唇裂、腭裂、低鼻梁、鼻上翘等颅面异常；心脏缺损、小头畸形、精神迟滞、指甲发育不全；还可表现为子宫内发育迟缓丙戊酸钠的致畸作用也不容忽视，该药导致的胎儿异常包括脊柱裂、智力迟滞、行为障碍、尿道下裂、胼胝体部分发育不良、室间隔发育不良等。另外卡马西平、扑米酮、苯巴比妥等抗癫痫药物也有一定的致畸作用。
新一代的抗癫痫药物包括拉莫三嗪、加巴喷丁、托吡酯、非氨酯、替加平、奥卡西平、氨己烯酸、唑尼沙胺及左乙拉西坦等，它们在人体内的药物代谢动力学良好，蛋白结合率低，多不产生芳烃氧化代谢物，但是，目前尚未明确这些药物没有致畸作用，仍需要大样本的前瞻性研究资料的进一步证实。
因此，各国的癫痫治疗指南都明确提出育龄期女性妊娠后应谨慎使用抗癫痫药物
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