白癜风皮肤病变的基本病理基础就是表皮黑色素细胞部分或完全丧失功能，导致表皮黑色素细胞及黑色素颗粒显着减少。白癜风的发生是由于其表皮黑色素细胞功能亢进，促使细胞受到耗损而过早衰退，也可能是由于其表皮黑色素细胞本身合成的黑色素的中间产物或代谢产物过多积聚，这些物质的毒性作用破坏了黑色素细胞。
接触化学脱色物质常会导致皮肤色素减退或消失，而引发白癜风氢醌单苯醚作为生产橡胶的氧化剂广泛地存在于橡胶制品中，其结构与黑色素中间产物相似，长期戴橡胶手套者就可能在手背和前臂发生色素减退斑。
有些白癜风患者自身存在黑色素细胞固有缺陷，这可能与遗传因素有关，白癜风患者皮肤白斑旁边的皮肤也存在着超微结构的异常改变，即使在稳定期和恢复期白癜风患者皮肤中仍有这些异常变化。
白癜风患者还存在黑色素细胞生长因子缺乏，从未经治疗的白癜风患者的正常皮肤处取材培养的黑色素细胞进行培养，可以发现细胞生长缓慢，或生长完全停止，这与体内黑色素生长因子缺乏有关。
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