病毒感染也是造成再生障碍性贫血的病因之一，其中肝炎病毒是比较明确的可以引发再生障碍性贫血的病毒。病毒性肝炎和再生障碍性贫血关系是比较明确的，临床上称为病毒性肝炎相关性再生障碍性贫血，是病毒性肝炎最重要的并发症之一。
病毒性肝炎并不一定都会引起再生障碍性贫血，只有一少部分患者会发生，再生障碍性贫血患者中有超过3%为病毒性肝炎患者。可以引起再生障碍性贫血的病毒性肝炎类型至今尚不能确定，大部分为非甲非乙型肝炎、丙型肝炎和乙型肝炎。甲型肝炎和戊型肝炎引发再生障碍性贫血的病例较少见。
肝炎相关性再生障碍性贫血在临床上分为两种类型，即急性型和慢性型。急性型占大多数，患者起病较急骤，肝炎发病后平均10周左右发生再生障碍性贫血。
这时虽然肝炎已进入恢复期，但由于全血细胞减少，会导致病情重，生存期明显缩短。慢性型较少，多发生在慢性肝炎迁延期病情较轻，病程常较长，生存期也较长。其发病机制与肝炎病毒对于造血干细胞有直接抑制作用，并介导自身免疫异常有关。
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