生殖器疱疹的人群的感染率随时间、地域及研究人群的人口学特征和社会经济学状况的不同而不同。
时间差异
美国进行的一项统计研究显示，1976年至1980年间15~74岁人群中单纯疱疹病毒2型血清感染率为16.4﹪，而1989年至1991年间则为21.7﹪。
地域差异
生殖器疱疹的流行也存在着较为明显的地域差异。在英国，性病门诊就诊的异性恋男性和女性单纯疱疹病毒2型血清感染率分别为27﹪和37﹪。在澳大利亚，性病门诊就诊者中单纯疱疹病毒2型血清感染率为40﹪。
在发展中国家，单纯疱疹病毒2型感染的流行更为严重，普通人群的血清感染率高达60﹪~90﹪，尤其在妓女、同性恋者、艾滋病患者中更高。有报告称，坦桑尼亚的姆旺扎25岁以上的女性和30岁以上的男性中单纯疱疹病毒2型血清感染率分别为75﹪和60﹪。
乌干达的所有人口中单纯疱疹病毒2型血清感染率为68﹪，这些都明显高于美国普通人口中的单纯疱疹病毒2型血清感染率。
人群差异
近年来的流行病学研究表明，不同人群的单纯疱疹病毒2型感染率有着较大差异。在美国，普通医疗门诊患者中单纯疱疹病毒2型感染率为25﹪，产科门诊孕妇中为30﹪~40﹪，性病门诊就诊的异性恋者中为40﹪~80﹪，HIV感染者中为60﹪~80﹪，在校大学生中为2﹪~4﹪家庭保健诊所就诊者中为25﹪~30﹪。
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