生殖器疱疹和软下疳均为性传播疾病，临床表现有时容易混淆，因此正确认识两者的不同之处十分重要。
1、病因不同
生殖器疱疹是由单纯疱疹病毒侵犯生殖器部位的皮肤、黏膜引起的炎症性、复发性的性传播疾病。
软下疳是由杜克雷嗜血杆菌引起的疼痛性、溃疡性的性传播疾病。
2、发病人群的差异
生殖器疱疹的发病以女性患者居多。
软下疳常见于男性，女性相当少见，男女比例约为9:1，造成这种现象的原因可能与发生于阴道及宫颈的损害不引起症状，难以发现有关。
3、临床表现不同
生殖器疱疹的典型表现：生殖器部位出现粟粒状丘疹、水疱，可融合成片，破溃后形成糜烂和溃疡，自觉灼痒、疼痛，最后结痂自愈，病程约为2～3周。
软下疳的典型表现：初起为炎性小丘疹，约24～48小时后迅速形成脓疱，3～5天后破溃形成溃疡，境界清楚，呈圆形或椭圆形，边缘为锯齿状，溃疡底部有黄色猪油样脓苔，剥去脓苔可见出血本病最突出的特点为溃疡疼痛剧烈。
需要注意的是，如通过以上比较，生殖器疱疹和软下疳仍难以鉴别，可通过病原体分离法辅助鉴别。
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