急性肾盂肾炎是肾盂黏膜及肾实质被细菌感染引发的疾病，常因诊断或治疗不及时而并发败血症，病情严重时可导致患者死亡，其原因可能有以下几点。
长期的慢性细菌性感染引起肾组织的持续性破坏
急性肾盂肾炎诊断或治疗不及时可转变为慢性肾盂肾炎，使肾组织长期被细菌侵蚀，使肾组织被广泛破坏，如出现肾盂扩大、畸形、肾皮质及乳头部有瘢痕形成、肾脏缩小、肾髓质变形等，严重时可出现肾实质广泛萎缩。
泌尿系统结石及梗阻引发或加重感染
肾盂肾炎时肾功能发生异常，易形成泌尿系结石，同时肾组织坏死会发生组织脱落，结石或脱落组织都易造成输尿管梗阻，发生梗阻后，细菌在输尿管内积聚，易发生新的感染或使原有感染加重，引发败血症。
脂质代谢异常继发炎性反应
脂类是人体细细胞代谢更新必不可少的物质，发生肾盂肾炎时，脂类代谢出现异常，会出现细胞内脂类含量减少或增多，细胞功能出现异常甚至是坏死，坏死的细胞会引发炎症反应，加重感染。
人体免疫功能异常
肾盂肾炎使得机体的免疫功能异常，不能正确识别有害细菌，一些可引发感染的细菌被当成无害细菌，不能被吞噬细菌所吞噬，在体内大量繁殖，引发败血症。
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