对与非细菌性前列腺炎的治疗除药物外，尚有心理和手术治疗等方法处理。
心理治疗
疼痛和不适症状对短期疗程的抗生素治疗有反应，但对于药物治疗无效或具有明显的心理问题的患者最好与心理或精神医生合作进行心理治疗，以解除患者的心理压力。
除使用α肾上腺能受体阻滞剂外，治疗的另一个重要方面是对病情进行细致的解释，这有利于缓解患者的紧张情绪。要使患者了解此病的症状与癌症、不育、阳痿，或已知的性传播疾病并无必然联系，以此取得患者良好的配合。此外还应嘱咐患者禁用刺激性食物及禁酒，每日应行温水坐浴或会阴部热敷，前列腺按摩适用于那些因前列腺充血而引起性生活减少的患者。
手术治疗
对于有严重的会阴部、下腹部疼痛，经各种保守治疗2~3年效果仍不佳并且严重影响日常工作和生活的患者;严重的膀胱刺激症状，尿流变细，尿后滴沥，最大尿流率小于10ml/秒，残余尿大于100ml以上者;性功能明显减退者;直肠指诊有前列腺硬结，且硬结有明显压痛者，经与患者商讨，必要时可行手术治疗。
国内有报道称采用前列腺被膜十字切开，病灶可以充分引流，减轻对血管神经的压迫，硬化的膀胱颈和受压的尿道得以减压。
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