尖锐湿疣的治疗方法包括外用药物、内用药物及物理疗法，以外用药物治疗为主，可用的药物种类很多，抗癌药物就是其中的一类，常用的有以下几种。
1、5-氟脲嘧啶
5-氟脲嘧啶(5-Fu)是一种常用的外用药物，一般为5%的软膏或霜剂，可用于治疗男性阴茎、女性尿道内及两性肛周尖锐湿疣，每次敷15～20分钟，每日使用2次，3周为1疗程。也可做基底注射治疗，疣体较大时可重复使用。
2、噻替哌
多用于5-Fu治疗失败的尿道内尖锐湿疣患者，每日用1次栓剂，8日为1疗程。也可将4个栓剂加入10～15ml消毒水中，做尿道内灌注，保持30分钟，每周治疗1次。
3、秋水仙碱
多用于阴茎尖锐湿疣的治疗，将药物溶于生理盐水制成2%～8%的溶液，外涂患处，隔3日再涂，该药有较强的腐蚀性，要控制用量，避免引起浅表糜烂。
4、争光霉素或平阳霉素
将争光霉素溶于生理盐水制成0.1%的溶液，在疣体局部做注射治疗，每次用量应控制在1毫升以内，一般小的疣体1次可去除。平阳霉素多用普鲁卡因做溶剂，将药物溶于普鲁卡因中制成10%的溶液，在疣体局部做注射治疗。
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