自身免疫性肝炎通常对免疫抑制治疗有应答，并且已经证明可以改善预后，但免疫抑制治疗有较多副作用，应严格掌握治疗指征，尽量避免试验性治疗。
1、及早治疗
实验室检查指标严重异常，血清AST>正常上限10倍或血清AST>正常上限5倍，且g-球蛋白或IgG>正常上限2倍的患者;临床急性恶化，出现疲劳、关节疼痛、黄疸等临床症状的患者;有中度至重度的界面性肝炎、桥接坏死、多小叶塌陷等组织学改变的患者应及时采取治疗措施。
2、根据患者具体情况判断是否治疗
血清AST和/或g-IgG低于绝对指征的患者和轻度界面性肝炎患者应根据患者具体情况判断，对免疫抑制剂应答较好、诊断明确者应积极给予治疗。
3、暂不需治疗，密切观察病情变化
对无症状无症状和轻度界面性肝炎或汇管区肝炎患者可暂时不进行治疗，但需要密切观察病情变化。
非活动性肝硬化和失代偿期非活动性肝硬化，也应密切观察病情变化。
4、考虑肝移植
对肝衰竭或暴发性表现而对免疫抑制治疗失败的患者应考虑肝移植。
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