自身免疫性肝炎的治疗的主要目的是缓解症状，改善肝功能及病理组织异常，减慢向肝纤维化的进展。根据多种因素制定方案、选择理想治疗重点、病情缓解后药物减量、延长巩固治疗的时间是取得较好治疗效果的重要措施。
1、根据多种因素制定方案：药物及剂量选择应个体化,根据临床症状、血清转氨酶及血清丙种球蛋白/IgG升高程度和组织学发现来判断病情严重程度,同时兼顾潜在的药物不良反应综合制定治疗方案。
2、选择理想治疗终点：自身免疫性肝炎患者理想的治疗终点是解决了所有反映疾病活动性的临床、实验室和组织学表现。AST、γ球蛋白、IgG复常，结合组织学改善将停药后复发的相对危险度降低了3～10倍。
3、病情缓解后药物减量：常规疗法应持续用至病情缓解、治疗失败、不完全应答或药物毒性作用，一旦病情缓解就应考虑药物减量。
4、延长巩固治疗的时间：有60%的患者在反映炎症的指标恢复正常情况下停药仍有复发，应治疗至γ球蛋白、IgG复常，延长巩固治疗的时间是减少自身免疫性肝炎复发的重要因素。
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