自身免疫性荨麻疹是指由于血液中存在具有刺激组胺释放的自身抗体而导致的荨麻疹，发病机制尚未完全明了，可能与以下几点有关。
一、自身抗体的作用机制
有学者发现在一部分患者血液内存有一种或几种诱发组胺释放的循环因子。
进一步研究发现这种介质的活性几乎完全归因于自身抗体IgG的直接作用，他们大多与肥大细胞及嗜碱粒细胞表面的高亲和力性IgE受体结合，而较少直接与IgE抗体结合。结合IgE受体后可能起到了一种持续的炎性刺激作用，导致补体活化、肥大细胞脱颗粒及组胺释放，同一般的过敏原引起肥大细胞脱颗粒机制不同处是自身抗体只有在产生一种补体活化产物时才能够诱发肥大细胞脱颗粒。
二、与自身免疫的相关性
慢性荨麻疹患者中大约有25%~50%具有自身免疫基础，其中与自身免疫性甲状腺病、白癜风、胰岛素依赖型糖尿病、类风湿性关节炎等疾病的关系较明显。现已证明15%的慢性荨麻疹患者具有抗甲状腺的自身抗体。
三、补体在自身免疫荨麻疹发病中的作用
对补体在免疫荨麻疹中的作用，可以通过对一部分患者血清进行加热使其中的某些有活性的补体成分丧失活性来研究他们的作用。相关学者通过研究人类皮肤肥大细胞证实了慢性荨麻疹患者血清具有诱发肥大细胞释放组胺的功能，这种功能依赖于补体的作用，而且自身抗体IgG只有在完整的补体系统协同下才能发挥组胺释放作用。
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