原发性闭经患者常存在内分泌异常，通过调节内分泌可以使部分患者出现月经，主要有以下几种方法：
人工周期
人工周期是按卵巢生理活动的规律补充外源性雌激素和孕激素，从而促使卵巢功能恢复和自然行经的方法，可直接治疗因卵巢功能不足所致的原发性闭经。对身材过高，骨骺未愈者需坚持治疗一年以上，使身高不继续增长。
补充雌激素
1.子宫小或不能肯定有无子宫者，给予倍美力，从每天0.3mg用起，根据情况逐渐可用到每天0.625mg。1-3月再作B超检查有无子宫以及子宫大小。
2.无子宫者、第二性征缺乏者、切除睾丸者、卵巢发育不良或无卵巢者给予小剂量雌激素补充，长期治疗。
雌激素与雄激素联合应用
骨骺未愈合的身材矮小者应于补充雌激素前，用小剂雌雄激素以增加身高，一般3-6月可增高2-3cm。较长时间应用，可使身高达150cm以上。
对症补充其他激素
甲状腺功能低下者、先天性肾上腺皮质增生者应根据患者病情补充甲状腺素及肾上腺皮质激素。
使用溴隐亭
高催乳激素血症导致的原发性闭经，卵巢功能正常者，一般愈后较好，可用溴隐亭使催乳素下降，促进排卵。从每天1.25mg起用，逐步增加至催乳素正常，再略减量以长期维持，同时测基础体温，以观察月经排卵情况。
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