目前可治疗尖锐湿疣的方法有很多，主要包括：冷冻治疗、激光治疗、微波治疗、电烧灼、手术治疗等。
1、冷冻治疗。冷冻治疗最大好处是局部不留痕迹，治愈率约70%，可分喷雾法或直接冷冻法，以液氮或二氧化碳干冰冷冻皮肤的病损，使疣体损害局部水肿、坏死，以达到治疗的目的。
适用于平坦较小的疣体。
2、激光治疗。特点是见效快，治疗后疣体可马上脱落。常用的是二氧化碳激光，烧灼疣体。但由于激光光束的过于集中，激光治疗只适用于较小疣体的尖锐湿疣在疣体较大时，激光治疗的复发率相对较高。
3、微波治疗。90年代后兴起的治疗方法。它的原理是利用微波的高频震动，使疣体内部水分蒸发，坏死后脱落。特点是不易复发，但创面恢复较慢，容易引起继发感染所以微波治疗特别适用于治疗较大、孤立和散在的疣体。
4、电烧灼治疗。一种比较老的治疗方法。常用高频电刀或电烙铁烧灼寻常疣、色素痣及其他皮肤赘生物。特点是操作简单有效，但其疮面的愈合较缓慢。
高频电刀可直接切除和干燥疣体，治疗彻底。电烧灼治疗可用于任何尖锐湿疣的治疗，但是对施术者的技术要求较高，烧灼太过或不足都是有害的。
5、手术治疗。一般情况尖锐湿疣一般不主张手术治疗，手术治疗后尖锐湿疣很容易复发。但对于疣体较大的患者也可考虑手术治疗，为防止复发，术后必须配合其他的治疗。
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