正常情况下卵巢排卵后，卵泡将黄素化形成黄体并分泌雌孕激素，分泌量于排卵后7-8天达高峰，然后于月经前1-2天迅速下降。若垂体促性腺激素及雌激素分泌不足，则卵泡发育成熟将不会完善，卵巢虽能排卵，但黄体发育常受影响而出现黄体功能不足的现象。
黄体功能不足包括黄体期缺陷和黄体期缩短，可引起分泌期子宫内膜发育不良而致孕卵不易着床，或虽着床而早期流产。有些妇女受孕后流产极早，可能仅见到月经周期延迟了1天至数天。临床上无从察觉是流产，有人称之为隐匿妊娠。黄体功能不足约占不孕病因的3%-8%。
黄体功能不足的病因可能是来自垂体促性腺激素分泌功能欠佳或黄体生成素/卵泡刺激素分泌的时相与协调不适当，也可因子宫内膜的雌激素增殖作用准备不足或内膜对黄体激素反应欠缺，部分原因可由高催乳素血症引起。近年有报道，黄体缺陷常发生在不孕症的治疗过程中，如临床上常见经克罗米芬治疗后，诱发排卵率虽高而妊娠率相对较低。有人报道，用克罗米芬治疗观察到黄体期缺陷占20%-50%。因此，用诱发排卵药物不应仅观察其是否能促成排卵，还需注意排卵后的黄体功能是否良好。
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