生殖器疱疹是单纯疱疹病毒感染所引起的性传播疾病。单纯疱疹病毒具有嗜神经性，常在骶神经细胞内建立潜伏感染，当人体免疫力低下时，病毒会沿神经髓鞘下行返回经常受累部位的皮肤黏膜，引起生殖器疱疹复发。
疾病复发时，皮肤损害常在同一部位。
微波产生的热效应有效率高、穿透力强，其作用深度为3～5cm，穿透力可通过脂肪层到达肌层，使蛋白组织在几秒内凝固、变性、坏死。同时血管收缩封闭，使治疗创面不出血而且创面热损伤对皮肤组织损伤小，愈后无瘢痕。
微波治疗生殖器疱疹的原理：基于生殖器疱疹常造成同一部位皮肤损害的特点，用微波破坏皮损处的神经细胞蛋白质，切断疾病复发的途径，从而达到预防生殖器疱疹复发的目的。
微波治疗生殖器疱疹的具体操作方法：首先按无菌原则对患者皮损处进行消毒，采用局部浸润麻醉的方法，将微波治疗仪调至合适的功率，并选择恰当的探头。
然后使探头头部轻微接触疱疹皮损表面，停留3～4秒后，换下一处疱疹皮损。每点治疗直到局部发白，并有轻微的爆炸声为止，治疗时探头由皮损面中央向四周逐点移动，边缘达正常上皮0.3cm。治疗后皮损呈白色或微黄色，创面小者局部使用抗生素软膏;创面大者以紫草油纱包扎，术后口服抗生素，以预防感染。
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