如果扁平足患者进行非手术治疗失败，还可根据病变类型选择相应手术治疗，但需要注意不同时期的扁平足患者其手术方式也不同。
1期患者
手术切除发炎的腱鞘和腱周组织，可以减轻症状。
但此手术并不能改变足部的其它异常，因此长期效果并不好，目前已很少单独使用。肌腱炎致使肌腱退变切除病变的肌腱后，可以直接缝合或用屈趾长肌腱加强胫后肌腱。
2期患者
2期患者治疗的主要目的是加强胫后肌腱、纠正跟骨外翻合足的外展、稳定足的内侧柱、保留距下关节的活动。由于足的畸形是可复性的，可以通过软组织和截骨手术纠正畸形保留关节活动；
对于内侧柱不稳定者，需要行距舟、舟楔或跖楔关节融合；
胫后肌腱功能不全者，可以使用屈趾长肌腱或屈拇长肌腱移位重建胫后肌腱，但单纯胫后肌腱重建手术效果并不满意，常需要同时行跟骨内移截骨，达到双重肌腱移位的效果。
近些年来，已有应用距下关节阻滞术治疗2期成人获得性平足症的报道，此手术使用内植物植入跗骨窦，使距下关节仍有部分的活动。根据需要以后还可取出内植物，完全恢复关节活动。
3期患者
处于3期病变的患者，其足部的畸形已固定，需要进行距下关节融合或结合距舟关节融合，甚至三关节融合，以纠正畸形、稳定关节。
4期患者
处于4期病变的患者可能需要行三关节融合、四关节融合或人工关节置换加距下关节融合。
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