口腔黏膜是人体免疫系统的第一道防线，保证口腔黏膜健康、完整、功能正常对于预防口腔溃疡有重要作用。目前认为，口腔黏膜的主要作用主要包括：
1、上皮屏障：口腔内有大量的微生物以及它们的毒性产物和其他潜在的有害物质，完整的口腔黏膜上皮可阻止微生物进入深层组织的牢固天然生理屏障，阻止微生物和毒性物质的侵袭，一旦出现破损，易造成病菌入侵。
2、感觉功能：口腔黏膜具有感觉功能，能够感知酸、甜、苦、辣、咸等味觉，此外口腔黏膜血管神经丰富，可对疼痛、触动和温度作出反应。
3、助消化功能：口腔黏膜可分泌唾液，对于说话咀嚼、吞咽消化以及某些药物的渗透性吸收有促进作用。
4、保护功能：咀嚼食物时口腔黏膜常常承受压力、切力、牵拉力和摩擦力，口腔黏膜可抵抗这些机械刺激，例如硬腭和附着龈黏膜有角化层以抵抗摩擦，并且紧密附着于其下方的骨组织以抵抗切力和压力，颊黏膜易于活动并寓有弹性利于组织的扩展，从而可缓解牵拉力。
此外口腔黏膜的感受器能启动吞咽、恶心和流涎等反射，也具有保护性。
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