目前应用最为广泛的结肠癌筛查方法即为大便潜血试验(FOBT)。采用FOBT进行结直肠癌的筛查能够使结肠癌的死亡率降低3%~15%。
通过FOBT筛查发现的结肠病变多为Dukes'A或，B期，这部分患者经治疗后预后较好，这是筛查降低结肠癌死亡率的主要原因。
另外，FOBT不仅可以发现早期的结肠癌，而且还可以发现一些腺瘤等癌前病变，因此通过FOBT筛查还可以降低结肠癌的发病率。
有临床工作者创立了免疫法便潜血试验结合个体危险隶属度函数(AD值)为初筛手段，纤维结肠镜为复筛的序贯筛栓方案，并在1989年对浙江嘉善县30岁以上者作为目标人群(共19.22万人)进行结肠癌筛查，随访8年，结果筛检人群结肠癌的累积死亡率下降了15%。
尽管FOBT简便、安全、经济，并且在结肠癌普查中取了明显的成功，但是一些医生仍保留怀疑态度，主要原因是FOBT缺乏一定的准确性，较高的假阳性率会导致一些被检者接受不必要的结肠镜检查。
更重要的是，假阴性结果将使一些有结肠病变的患者错误认为自己是健康的，延迟进行一些更为适当的诊断检查。而且FOBT不能像结肠镜那样能够区分息肉或癌，只能作出疑似诊断。
此外，FOBT不被推荐用于结肠癌高危个体的普查，这些人更适合采用结肠镜进行监测。
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