并非所有的外阴赘生物全为尖锐湿疣，有些皮肤病，与尖锐湿疣相混淆。
(1)生殖器鳞状细胞癌多见于50岁以上的男性，无不洁性交史，损害浸润明显，皮损较硬，初起为不痛的小结节，逐渐扩大，边界不清，易出血，常形成溃疡或菜花样增生，组织病理检查可以确诊。
(2)扁平湿疣为发生于生殖器部位的梅毒二期皮，呈肥厚性斑块，基底宽阔，无蒂，表面扁平湿润而糜烂，渗液中含有大量的梅毒螺旋体，梅毒血清试验阳性。
(3)生殖器鲍温样丘疹病多见于40岁以下性活跃的人群，呈多发性小的棕红色扁平丘疹，可有轻度光泽，直径2-10mm，可融合成斑块。可能与乳头瘤病毒感染有关，损害位于男性的龟头、阴茎干、女性的肛周和阴唇等部位。
(4)假性湿疣多发生在已婚青年妇女.疼疹局限于女性小阴唇，粟粒大小淡红色丘疹，表面光滑，多数呈现鱼籽状和细小绒毛状，有些亦呈息肉状，互不融合，长期不变，醋酸白试验阴性d可能为生理性改变，也可能与阴道念珠菌及慢性刺激有关。
(5)皮脂腺异位症是皮脂腺异位发育和增生所致，在阴茎龟头、阴唇黏膜可见微高于皮肤，淡黄色丘疹，组织学检查为成熟的皮脂腺小叶，醋酸白试验阴性。
(6)传染性软疣呈单个不融合的肤色半球形丘疹，周围光滑，中央可挤出软疣小体。
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