由于尖锐湿疣的发病率在逐年上升，对它的传播途径的了解是非常必要的。其主要的传播途径有以下几条：
(1)性接触传播：这是主要的传播途径。据研究有2/3与尖锐湿疣患者有性接触的人可发生本病。病期平均在3个半月时传染性最强，故在性混乱者中最易感染本病。此外，女性同性恋者之间可传播。由于HPV传播仅需皮肤一皮肤接触，致使女性之间可直接的生殖器一生殖器或手指一生殖器接触而获得传播；在欧美国家通过共享性玩具传播的可能性存在，从手指上已检出生殖器型HPV病毒的存在。
(2)自体接种：极少数生殖器疣可以是自身其他部位的瘊子经搔抓等途径传染到外生殖器部位而发病，在医学上称为“自体接种”，如HPV1、2既可引起皮肤疣又能导致生殖器疣。
(3)污染物传播：许多污染物可检出人乳头瘤病毒的DNA，如患者的内衣、内裤、浴盆、浴巾等，但是这一传播途径是极其少的。
(4)母婴传染：婴幼儿尖锐湿疣或喉乳头瘤病，可能是分娩过程中胎儿经过感染HPV的产道或在出生后与母亲密切接触而感染的。然而，从孕妇的外周血、外周血单个核细胞和羊水中亦检出人乳头瘤病毒DNA，提示病毒可能穿过胎盘屏障并引起胎儿宫内感染。
其他的传播途径包括血传播（罕见）及经过毛囊的传染。尖锐湿疣病毒可以贮存在人体的毛囊中，病毒随毛囊皮脂腺的分泌而传染，毛囊可以作为HPV的内源性贮存灶，可能在生殖器疣的复发中起重要作用。
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