尖锐湿疣的治疗临床上以外治为主，其中物理治疗和药物治疗都是常用的方法。物理治疗以激光、冻等为主，而药物治疗多采用具有腐蚀疣体的药。
(1)5%5-Fu软膏：即5-氟尿嘧啶软膏。是一用的抗肿瘤药物，它能抑制细胞的增殖，力量较为温和，一般需治疗2～3周。
(2)30%三氯醋酸：是一种强酸，可用来烧灼疣体，每周用药2次，要注意保护周围皮肤和粘膜。
(3)疣脱欣：为高效的治疗尖锐湿疣的药物，刺激性较轻，外用局部，每日1次，3-5天即可。
(4)20%的足叶草酯酊：每周用1～2次。本药有副作用，要注意保护周围皮肤粘膜，涂药2～4小时后洗去。有致畸作用，孕妇禁用。
(5)干扰素：局部外用干扰素通过刺激T细胞及对病毒的抑制作用而起到治疗效果，对小的尖锐湿疣有一定效果。外用的优点是药物无刺激性，局部不会出现红肿、疼痛等不良反应。缺点是起效较慢，需连续外用4～6周。
(6)5%咪喹莫特霜：也是一种免疫调节剂。外用，与干扰素相似。优点是药物无刺激性，局部不会出现红肿、疼痛等不良反应。缺点是起效较慢，需连续外用6周以上。
(7)复方硝酸溶液：主要成分为硝酸、醋酸、草酸二水合物、乳酸等，可选择性腐蚀疣体，对正常粘一膜刺激小。一般用药后1～2天疣体可脱落。
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