再生障碍性贫血会引起全血细胞减少，但全血细胞减少不等于一定是患了再障，全血细胞减少的发病机制有两种：一是骨随造血功能相对衰竭，二是外周血细胞破坏过多。
前者可见于叶酸和维生素B12缺乏，骨髓增生活跃，红细胞无效生成。骨髓纤维化、转移癌、急性白血病、广泛感染(如结核病、真菌感染）可破坏骨髓正常结构，导致骨髓造血功能衰竭。某些克隆性疾病或癌前病变如PNH、低增纠生MDS可因正常干细胞衰减导致骨髓造血功能衰竭。或者骨髓本身增生低下，如再障。
外周血破坏增加主要见于脾功能亢进，也可见于造血前体细胞自身免疫性破坏、急性造血功能停滞。可见再障只是全血细胞减少的一种病因，遇到全血细胞减少的病人要做仔细的鉴别，千万不可妄下结论。
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