中医学认为，任何疾病都是由于正邪斗争的结果，生殖器疱疹也不例外。其病性早期属热证、实证，为湿热、毒火阻滞肝脉；后期则伴有肝肾不足。
(1)湿热下注：素日多食肥甘厚味、辛辣之品，一或嗜烟酒，损伤脾胃，脾失健运，水湿内蕴，郁而化热，以致湿热蕴积于下焦，注于阴部，发为生殖器疱疹。
(2)外感淫毒：淫欲过度，不洁性交，外染毒邪，蕴结于局部皮肤黏膜，则发为生殖器疱疹。外感淫毒对发病是非常关键的，虽然是湿热之体，但未有不洁性交也不会发病。
(3)肾气不足：肾开窍于前忌二阴，或由于房劳过度，或由于湿热、淫毒久稽，耗伤肾阴；日久阴损及阳，也可造成肾阳不足。肾阴肾阳是人体最宝贵的物质，统帅着人体全身的阴阳，当肾阴肾阳受损后，人体阴阳就会失调，疾病就容易复发。
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