根据病史、临床典型表现可做出生殖器疱疹的临床诊断，再辅助下列实验室检查结果即可明确诊断。
(一)细胞学检查
以玻片在疱疹底部作印片，Wright一Giemsa染色，显微镜下见到具有特征性的多核巨细胞或核内嗜酸性包涵体，此法敏感性低。
(二)病毒抗原检测
从皮损处取标本，以单克隆抗体直接免疫荧光试验或酶联免疫吸附试验检测HSV抗原，是临床常用的快速诊断方法。
(三)病毒培养
取皮损处标本进行病毒培养、分离、鉴定、分型，是诊断HSV感染的“金标准”，但操作复杂，花费大。
(四)核酸检测
已有报道应用核酸杂交技术及PCR技术诊断生殖器疱疹，可提高诊断的敏感性并可进行分型。
(五)HSV抗体检测
采用蛋白印记试验和部分ELISA试验测定血清型特异性抗体。HSV-1及HSV-2型特异性血清抗体检测,尤其IgM检测异性血清抗体检测是发现亚临床或无症状感染最可行的手段。
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