原发性肝癌：肝癌肿块较大，中心出现坏死，特别是并发感染时与肝脓肿不易区别。但肝癌坏死区密度高于脓液，形态呈裂隙状或不规则状，病灶增强环通常为厚薄不均。有时可见结节状阴影，边缘高低不平，增强持续时间短。增强后病灶边缘与正常肝组织之间分界更为清晰。
如伴有门脉癌栓、腹膜后及肝门淋巴结肿大和甲胎蛋白(AFP)升高则更自助于肝癌的诊断。短期治疗复查病变明显好转也支持肝脓肿的诊断;
肝血管瘤：动态增强扫描血管瘤往往有典型的CT表现，一般不难鉴别。但在血管瘤较大，中心出现无强化区时也易与肝脓肿相混淆。但血管瘤没有急性感染症状，如发热、肝区疼痛、白细胞数常升高等炎性反应。增强后没有肝脓肿的靶征、一过性肝段强化等典型征象可资鉴别.
肝转移瘤：肝转移瘤一般有原发病灶，且肝内病灶多发，常均匀分布于肝左右叶，病变形态多为结节状。但肝内单发囊状转移瘤与肝脓肿也不易区别。但肝转移瘤没有全身感染症状，病灶周围没有水肿，而脓肿只有在较大的病灶才有环状强化。
综上所述，肝脓肿：表现发热、肝区疼痛、有炎症感染症状表现，白细胞数常升高，肝区叩击痛和触痛明显，左上腹肌紧张，周围胸腔壁常有水肿。
临床反复多次超声检查常可发现脓肿的液性暗区。超声导引下诊断性肝穿刺，有助于确诊。CT扫描特别是动态增强扫描能够较好显示肝脓肿病变特点，解释其病理过程，结合临床能够对肝脓肿做出全面正确的判断，为临床治疗提供影像学依据，比较容易与肝癌区分。
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