肝脓肿是一种特别容易与肝癌混淆的疾病，尤其是少数不典型的肝脓肿，症状与肝癌相似，更容易使医生做出错误的诊断，这就需要患者自身对两种疾病都有所了解，在临床诊断时，为医生提供更有效的参考信息。
肝脓肿主要有两种：一种是细菌性肝脓肿，一种是阿米巴性肝脓肿。细菌性肝脓肿往往因为胆道炎症或败血症没有得到有效控制，细菌经胆道逆行进入肝脏，或者经血液循环进入肝脏，在肝脏中形成脓肿。阿米巴性肝脓肿是一种叫阿米巴原虫的致病微生物引起的，常表现为肝脏右叶的巨大性病灶。
临床上细菌性肝脓肿较常见，典型症状包括发热，白细胞升高，肝区疼痛，B超或CT可见病灶中央液性暗区和周围炎症水肿带的表现，一般不难与肝癌鉴别。
但少数不典型的肝脓肿，特别在其病程初期，容易和甲胎蛋白阴性而又有中心坏死的肝癌混淆，引起误诊，此时就需要仔细了解病史，肝脓肿多有发热或菌痢病史，多伴有血白细胞增高，如果给予抗感染治疗，病灶会在短期内缩小。
而肝癌则多有乙肝或肝硬化的病史，血白细胞少有升高。
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