生殖器疱疹呈自限性，也就是说可以自行控制，发病后1～2周自然消退。当机体抵抗力下降又会发作，如此反复不止，很难根治。中药治疗对控制急性炎症疗效较好，抗复发疗效显著。
内服方：黄柏50克，板蓝根60克，大青叶30克，马齿苋60克，薏苡仁60克，土茯苓60克，蒲公英20克、白藓皮15克、蝉衣10克，生甘草12克。
煎水分3次服，每日1剂，本方用于急性炎症期，一般连服7～10天后烧灼、红肿、疼痛刺麻感消失，水疱干涸，溃疡面愈合，急性炎症可得到全面控制。此方去黄柏，加黄芪60克煎水内服，每日3次，每两天1剂一共内服15剂可控制.复发，适宜急性炎症期控制后的抗复发治疗。
外洗方：黄连10克，板蓝根20克，金银花15克，苦参15克，百部15克、野菊花15克，薄荷10克后下，水煎外洗患处，适用于急性炎症期。
上述药方具有清热、消肿、止痛、抗病毒、增强免疫力等功效。
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