重度心肌炎可能会致命，主要与心肌损伤程度、并发症严重性、治疗时机、基础疾病、年龄等因素有关。
重度心肌炎指心肌组织广泛炎症导致心脏收缩功能严重受损。病毒直接侵袭心肌细胞引发免疫过度反应是常见机制，暴发性心肌炎可在24小时内出现心源性休克。急性期心肌细胞水肿坏死导致心输出量骤降，左心室射血分数可能低于30%，同时合并恶性心律失常如室性心动过速或三度房室传导阻滞。心内膜活检可见大量淋巴细胞浸润伴心肌纤维断裂，血清肌钙蛋白水平常显著升高。
部分患者虽度过急性期仍可能进展为扩张型心肌病，心脏逐渐扩大伴随慢性心力衰竭。合并多器官功能障碍综合征时死亡率显著增高，需体外膜肺氧合支持。老年患者或合并糖尿病者预后更差，延迟使用免疫球蛋白治疗会影响恢复。儿童暴发性心肌炎起病更急骤但部分病例对激素反应良好。
确诊重度心肌炎需立即住院监护，严格卧床休息减轻心脏负荷，限制钠盐摄入每日不超过3克。恢复期应避免剧烈运动3-6个月，定期复查心脏超声评估心功能，接种流感疫苗预防呼吸道感染。出现胸闷气促加重需及时复诊，长期服用血管紧张素转换酶抑制剂者需监测血钾水平。
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