目前治疗尖锐湿疣的多为口服药物，主要包括西药和中药两类。但是，治疗尖锐湿疣的药物比较多，而患者缺无法确定到底哪种药物比较好。其实尖锐湿疣吃药治疗效果是微乎其微，基本上用处不大。
这是因为尖锐湿疣的病毒并不在体内，是在皮肤的表皮层和真皮层之间。
1)西药：西药的特点是起效快，可以轻微的缓解不适症状。以往尖锐湿疣诊疗医生常开一些诸如：阿普洛韦、更昔洛韦、干扰素和白介素之类的口服激素西药，作为辅助治疗。光吃这些药物不能治愈尖锐湿疣，停药即复发，而且对肝肾损害大。
2)中药：中药的特点是副作用小，诸如一些清热解毒的中成药或草药，一定程度上可以缓解症状，但是疗效慢、药性不稳定、提纯度底、治疗时间长，只能起到缓解或改善作用，不能从根本上消除尖锐湿疣病毒体，因此，临床专家常不建议采用。
很多临床专家甚至明确的告诉患者，尖锐湿疣光靠吃药是没有用的。尖锐湿疣病毒体抗药性极强、复发率特别高，临床治愈的两大关键点：一是除疣体二是防复发，主要是防复发。很多不适当的药物治疗甚至会加快疣体复发率，因此，选择科学正规的疗法是关键。
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