先天性巨结肠给患者带来的危害很大，先天性巨结肠是一种多基因的遗传病，多见于男性中，另外，胚胎发育不全或者孕期母亲营养不良，也有可能引起先天性巨结肠，但是先天性巨结肠发病率极低。
对于先天性巨结肠的危害，首先要认识到其症状。一般来说，胎儿出生后的24小时内会排出第一次胎便，而且会在两三天内排尽，如果在婴儿出生后的两天内没有排出第一次胎便，就要注意了，因为，先天性巨结肠的孩子的肠管处于痉挛狭窄状态，会导致胎便不能通过，此时要注意食用肥皂条等方法帮助孩子把胎便排出。
先天性巨结肠有危害吗?是的，先天性巨结肠危害极大，而且，先天性巨结肠荣誉出现小肠结肠炎并发症，可导致整层肠壁的坏死，穿孔，腹膜炎，败血症和死亡。因此，先天性巨结肠患儿病发小肠结肠炎后，会引起腹泻，容易产生脱水酸中毒高烧、肪快、血压下降，如果治疗不及时的话，有可能导致婴儿死亡。
目前治疗先天性巨结肠只有靠手术，常用的手术方式、方法很多，但最终的目的都是切除病变痉挛肠段，恢复局部正常肠蠕动，消除腹胀，能够自主排便。只有部分短段和超短段病人可以采用保守治疗的方式。
近年来巨结肠根治手术年龄已从1~2岁提前到生后6个月甚至更早，在新生儿期施行一期巨结肠根治术者越来越多，可避免小肠结肠炎、营养不良等并发症的发生，取得了很多的疗效。术后应训练患儿排便习惯，并在医生指导下每周扩肛1~2次，共3个月，以提高远期疗效。
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