脑炎通常由病毒或微生物感染导致，大多数病例由病毒引发，细菌，真菌，寄生虫感染也是比较普遍的原因，脑炎也有可能由各种非感染性诱因引发，急性脑炎有很多种类型，比较常见的细菌性脑炎及病毒性脑炎等，那么，小儿脑炎的原因都有哪些？
常见的致病菌有流感嗜血杆菌和肺炎链球菌等。新生儿以大肠杆菌、副大肠杆菌、B簇溶血性链球菌和金黄色葡萄球菌等多见;婴幼儿以肺炎球菌、流感嗜血杆菌多见;年长儿则以肺炎球菌多见。由于小儿机体抵抗力较弱，血-脑脊液屏障功能发育尚未完善，故细菌容易侵入神经系统而发病。原发性免疫缺陷病、长期应用肾上腺糖皮质激素或免疫抑制剂易继发本病，并以葡萄球菌、铜绿假单胞菌及变形杆菌为多见。
病原体可通过多种途径感染中枢神经系统：如血行感染;邻近病灶直接感染;通过外伤致血一脑脊液屏障受损部位侵入及腰穿等医源性因素等。最常见的途径是血行(即菌血症)播散所致。细菌进入血循环后，其荚膜可干扰单核吞噬细胞系统的调理吞噬作用，且未经免疫的机体缺少IgA或lgM荚膜抗体，或有备解素系统等免疫缺陷者更无法克服细菌荚膜的抗吞噬作用。
随后，细菌通过侧脑室脉络膜丛及脑膜，随脑脊液播散至蛛网膜下腔并迅速繁殖。革兰阴性菌细胞壁脂多糖(内毒素)和肺炎链球菌细胞壁成分磷壁酸、肽聚糖等均可造成显著的炎症反应，并促使肿瘤坏死因子、白细胞介素-1、前列腺素-2等细胞因子的产生，从而导致中性粒细胞浸润、血管通透性增加、血脑屏障改变和血栓形成等病理变化。
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