肛瘘大多是肛周脓肿的后遗症，肛瘘的症状表现为肛门周围的外瘘口有少量脓性分泌物排出，会引起瘙痒不适。当外口阻塞或假性愈合，瘘管内脓性液体不能排出，即形成脓肿。有不同程度的局部红肿、疼痛、发热、全身乏力。
脓肿自行破溃或切开引流后，症状才慢慢消失，往往是“疼痛--流脓--缓解”反复出现。肛瘘的内口不消除，便会反复发作，久治不愈，因此肛瘘的治疗关键在于准确找到内口。
其实肛瘘大部分是由直肠肛管周围脓肿引起。
①肛门直肠周围脓肿破溃或切开多在肛门外，脓液从外口流出，但原发感染多在肛窦。肛窦则是继发感染的门户，反复感染，形成瘘道。
②瘘道多在肛门括约肌之间通过，由于括约肌经常不断地收缩与舒张，压迫瘘道，影响脓液的排除，容易贮脓感染而难以愈合。
③直肠内有一定的压力，将直肠感染物质如粪便、气体，可经常不断地从内口进入瘘道，刺激腔壁，继发感染后由外口排出，也是造成瘘道的原因。
④肛门直肠周围脓肿破溃后，脓液排出，脓腔逐渐缩小，外部破溃口和切口也缩小，腔壁形成结缔组织增生的坚硬管道壁，因而不能自然闭合。
⑤瘘道弯曲、或有窦、分支，引流不通畅，脓液潴留，反复感染，造成瘘道不易愈合。
⑥肛门静脉回流不畅，局部经常淤血，组织营养不良，影响愈合。
⑦结核杆菌、放线菌等感染所形成的脓肿，克隆氏病等难以自愈而形成特殊性肛瘘。
一般这种病例的病人，每当劳累过度、饮酒过量时，便出现肛门肿胀、大便过硬或腹泻、便痛、肛旁流脓血水的状况。
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