肾结石可能引发肾绞痛、尿路感染甚至肾功能损伤，其危害程度与结石大小、位置及是否引发并发症有关。
结石移动可能划伤输尿管黏膜，导致突发性剧烈腰腹部疼痛，常伴有恶心呕吐。急性发作时可遵医嘱使用双氯芬酸钠栓、盐酸哌替啶注射液等镇痛药物，配合热敷缓解痉挛。若结石直径小于6毫米，可通过多饮水、口服排石颗粒促进自然排出。
结石嵌顿在肾盂或输尿管可能引起肾积水，长期未处理会导致肾实质萎缩。超声检查可明确梗阻部位，必要时需行输尿管镜碎石术或经皮肾镜取石术解除梗阻，术后需定期复查肾功能。
结石作为异物易滋生细菌，诱发肾盂肾炎或脓肾，表现为发热、尿频尿急。需进行尿培养后选用敏感抗生素如左氧氟沙星片、头孢克肟分散片，严重感染合并梗阻时需先放置输尿管支架引流。
双侧尿路完全梗阻超过48小时可能造成急性肾衰竭，需紧急血液透析。慢性梗阻性肾病会逐渐进展为尿毒症，表现为肌酐升高、贫血，最终需长期透析或肾移植。
甲状旁腺功能亢进或痛风等代谢疾病既是结石成因也是并发症，需同步监测血钙、尿酸水平。草酸钙结石患者应限制菠菜摄入，尿酸结石需服用别嘌醇片并碱化尿液。
每日饮水量应达到2000-3000毫升，均匀分配于全天。减少高草酸食物如坚果、巧克力的摄入，适当增加柑橘类水果补充枸橼酸盐。长期久坐职业者建议每小时起身活动，定期进行泌尿系超声筛查。出现血尿、反复腰痛等症状时应及时就诊，避免盲目服用偏方延误治疗。
