各种条件允许的话，建议是所有肺鳞癌、肺腺癌的患者都做基因检测。首先最应该检测的是EGFR基因，其突变阳性的概率在我国非小细胞肺癌人中约占百分之三十以上，等于1/3的病人一线就适合吃TKI药物。患者等待基因检测可能需要较长的时间(一周至两周)，并且部分医院该部分是医保的，尤其需要强调的是这个等待是值得的，因为这个结果对下一步治疗至关重要。此外，还应该检测EML4-ALK融合基因，如果这个细胞发生融合基因表达阳性的话，另有靶向药物治疗，就是大众尚不熟悉的克唑替尼，但是发生率在我国加起来不过肺癌，我们优先做EGFR基因检测，再做EML4-ALK检测。
而不同基因检测的方法，所需要的时间也不尽相同。以检测ALK基因为例，采用Ventana IHC这种免疫组化方法大约12天就可以出结果;采用FISH(荧光原位杂交)时大概需要34天出结果;采用PCR(聚合酶链反应)这种比较复杂的分子生物学检测方法，则大约需要57个工作日出结果(国际上要求两周之内出基因检测结果)。
不同的基因检测方法，费用各不相同。其中，免疫组化检测相对便宜一点，大约需要几百元。其它的基因检测方法，如FISH(荧光原位杂交)和PCR(聚合酶链反应)则稍贵，而且不同医院因为需要检测的基因位点数量不同，检测数量越多越贵。
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