儿童再生障碍性贫血治疗过程中出现副作用建议进行密切的检测，一方面要进行对症治疗，另一方面，如果是副作用比较严重的时候，可以考虑药物减量或者是停止药物的使用。
儿童再生障碍性贫血的治疗主要是免疫抑制剂应用，免疫抑制剂的应用主要是环孢素等，免疫抑制剂的副作用主要是肝肾功能损害，高血压，高血糖，所以在治疗的过程当中要密切监测，如果副作用较小可以耐受，是不需要停药的，需要遵医嘱对症治疗就可以。
如果副作用较大，可以考虑药物减量或者是停止药物的使用，另外儿童再生障碍性贫血在治疗的过程当中也要密切的监测肝功能，必要的情况下联合保肝药物，比如谷胱甘肽等，如果联合保肝药物应用之后，肝功能依然是异常的，则需要停药。
儿童再生障碍性贫血的患者要注意预防感染以及出血的发生，不要进行剧烈的活动，不要吃辛辣刺激性的食物，适当的进行锻炼，提高机体的免疫力。
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