新生儿肺炎治好后通常不会留下明显的后遗症，但若病情较严重，则会有不同程度的后遗症。
1.若是由于细菌、病毒或支原体感染等造成的轻症肺炎，在治愈后一般不会留有后遗症;
2.若病情严重合并呼吸衰竭，缺氧时间长使用呼吸机通气以后或者给氧浓度高时间长，可能
会导致新生儿后期出现视网膜病变、支气管肺发育不良等后遗症；
3.若新生儿肺炎合并败血症，甚至脑膜炎，则可能会遗留神经系统后遗症，包括惊厥发作、智力障碍、癫痫、肢体瘫痪等。
新生儿肺炎早期症状有的不明显，且病情变化快，可能出现呼吸困难、暂停等情况，严重者会对肺部造成不可逆的损伤，甚至危及生命。因此当家长发现新生儿出现咳嗽、发热等异常症状时，要尽早就诊，以防病情加重对患儿带来不可逆伤害。
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