不同种类传播途径不尽一致。肺炎支原体主要经口、鼻分泌物与痰的飞沫而传播，长期密切直接接触也可以被感染发病。生殖道支原体主要通过性接触传播。肺炎衣原体和鹦鹉热衣原体通过空气中飞沫或气溶胶传播，沙眼衣原体通过接触传播性和母婴传播等。支原体是一类介于病毒和细菌之间的原核细胞微生物，临床上常见的致病性支原体包括肺炎支原体、人型支原体、生殖支原体和解脲脲原体。
肺炎支原体可通过呼吸道飞沫使易感者感染。另外，直接接触感染者的口鼻分泌物，或间接接触被分泌物污染的毛巾、衣物、餐具等，也可导致感染。人型支原体、生殖支原体和解脲脲原体主要通过性接触传播。衣原体是寄生在细胞内的一种微生物，寄生于人体的衣原体有三种：肺炎衣原体、鹦鹉热衣原、沙眼衣原体。关于各种衣原体的传播途径：肺炎衣原体，通过空气中的飞沫或直接接触传播；鹦鹉热衣原体是人体吸入受感染鸟的排泄物的干燥尘粒而感染；沙眼衣原体可通过性接触传播、间接接触传播（与患者共用毛巾或衣物、公共浴室、游泳池、公共马桶等）、母婴传播。
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