目前认为引起抗菌药物相关性腹泻最常见的病原体有金黄色葡萄球菌、伪膜性肠炎铜绿假单胞菌、鲍曼不动菌等。
抗菌素药物引起的相关性腹泻，通常是长时间使用，而且可能存在有消耗性的疾病，造成机体的免疫力下降，引起肠道菌群失调，导致有害细菌生长繁殖过多，有益菌过少，常见的病原体有金黄色葡萄球菌、伪膜性肠炎铜绿假单胞菌、鲍曼不动菌产酸克雷伯氏菌、产气荚膜梭菌、假丝酵母菌、沙门菌属等。
抗菌药物引起的相关性腹泻，首先要停止使用任何广谱抗生素，同时要增加益生菌的摄入，比如双歧杆菌、布拉氏酵母菌、地衣芽孢杆菌等调节肠道内环境，改善腹泻。
平时不可以自行服用抗菌素，需要在医师的指导下应用药物，不能滥用抗生素，以免导致肠道菌群紊乱。
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