扁平疣和妇科有没有关系需要视情况而定，但多数的扁平疣与妇科疾病是没有关系的。
1、扁平疣通常认为是由于感染了人乳头瘤病毒（即HPV），与妇科的HPV感染虽然属于同源病毒，但是扁平疣最主要感染的病毒是HPV3型，而妇科的HPV感染最主要的是48、51等其他类型，扁平疣多数与妇科疾病并没有关联。对于扁平疣的治疗在临床上常采用冷冻治疗祛除疣体，同时注意皮肤卫生，多食用新鲜水果和蔬菜，提高机体的免疫力；
2、若是疣体长在外生殖器部位，则有可能与妇科疾病有关系，若是疣体呈棕色或暗褐色的，表面较粗糙，有的还可以表现为菜花样，可有一个或多个，则可能为尖锐湿疣，建议就诊于当地医院进一步检查与治疗，在此期间应避免性生活，避免发生交叉传染。
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