儿童支原体咳嗽的治疗主要分为对症治疗和抗感染治疗。
对症治疗主要是针对咳嗽症状进行治疗。如果咳嗽比较明显，可以使用止咳药物对症治疗，如复方氢溴酸右美沙芬糖浆或福尔可定口服液进行止咳治疗。如果咳嗽痰多，临床上常用盐酸氨溴索口服溶液、氨溴特罗口服液等药物进行治疗，也可以选择中成药物进行治疗，比如肺力咳合剂、黄龙止咳颗粒、小儿清热止咳口服液、杏贝止咳颗粒等。
抗感染治疗主要是针对支原体感染进行治疗。大环内酯类药物，如罗红霉素、阿奇霉素等，是常用的抗支原体药物。喹诺酮类如左氧氟沙星、莫西沙星等，以及四环素类药物，如多西环素、米诺环素等，也可以用于治疗支原体感染。但是需要注意，大环内酯类药物和喹诺酮类药物对于儿童的安全性和有效性尚未完全确定，因此在使用时需要谨慎。
如果儿童出现发热等其他症状，也可以适当使用退烧药，如对乙酰氨基酚或者布洛芬等进行治疗。
治疗期间要避免刺激性食物和饮料，以免加重咳嗽症状。同时，要保持室内空气流通，保持适宜的室内温度和湿度，以促进身体的恢复。
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